Пещеры р. Лены весьма разнообразны по своему происхождению, форме и размерам. Одни из них представляют сложную систему лабиринтов из залов и коридоров, соединенных узкими ходами, другие — имеют вид ниш, гротов и арок. Встречаются на побережье Лены и холодные пещеры с ледяными сталактитами. Часть Ленских пещер служила местом для захоронения. На стенах некоторых пещер сохранились разнообразные фигурные рисунки различной давности, сделанные преимущественно красной краской. Более древние рисунки относятся к новокаменному веку. О некоторых пещерах р. Лены имеются легенды и предания. Лена на верхнем участке имеет спокойное течение и поэтому экскурсии в Ленские пещеры хорошо проводить на лодке.

В истоках р. Лены пещеры известны: 1) у села Большая Тарель по правой стороне р. Правая Иликта; 2) в долине р. Манзурки вблизи улусов Алан, Степно-Балтайского, у села Харбатово; 3) в скалах горы Байц; 4) по р. Ун-гуре (приток р. Манзурки) в скале «Узенькие подушки» и 5) в скалах правого берега р. Лены в 2 километрах ниже поселка Качуг. Все эти пещеры не исследованы.